Для того, чтобы Архиварикс работал корректно в связке с Nginx+PHP-Fpm (когда .htaccess) не работает, необходимо использовать следующий конфиг:
location / {
try_files $uri $uri/ /index.php?$args;
}
location ~* \.php$ {
fastcgi_index index.php;
fastcgi_pass unix:/var/www/php-fpm/websites;
try_files $uri /index.php?$args =404;
include fastcgi_params;
}