Бывают ситуации, когда не запускается DNS сервер или же просто не отдает информации о некоторых доменах, хотя записи существуют.

Вот, способ, как можно найти проблему:
В Debian выполняем:

# named -g -u bind

В CentOS:

# named -g -u named

И смотрим вывод сообщений.