При создании пользователя есть возможность отправки ему на email данные с доступами и адресом панели.

Проблема: не отправляются письма. Остальные письма отправляются корректно.

Решение довольно простое.

в ISPmanager есть пункт Шаблоны писем.

Открываем, к примеру, user.welcome — приветственное письмо пользователю.
Нам нужно всего-лишь прописать верный Email в графе отправитель. Вот и все.