Вот такая вот ошибка в ISPManager’e при добавлении домена (даже WWW):

Can’t reconfig DNS server. Make sure DNS service started and right configured.

Решается довольно просто — перезапуском DNS servera.

В Debian:

#/etc/init.d/bind9 restart

В CentOS:

#service named restart

Или же добавить права на чтение файлу rndc.key